| 課題名稱 | 項目來源 | 起止時間 |
| 免疫細胞的可塑性和代謝調控 | 科技部國家重點研發計劃項目主持 | 2023-2028 |
| 免疫細胞發育、分化和代謝調控機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2023-2028 |
| 多尺度鄰近標記解析組織微環境調控肝臟前體細胞分化的機制 | 科技部國家重點研發計劃項目主持 | 2023-2028 |
| 微生物組脂質代謝物調節腸道和皮膚發育與穩態建立的研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2022-2027 |
| 肺泡損傷修復再生的細胞基礎及全細胞圖譜繪制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2023-2027 |
| 精準靶向腫瘤細胞可控死亡的合成生物學研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2023-2028 |
| 器官移植后免疫抑制狀態下腫瘤發生和復發轉移的機制研究及精準診療策略建立 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2023-2026 |
| 復雜基因組的穩定遺傳機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2023-2028 |
| 基于人工智能的免疫制劑腫瘤原位治療技術體系建立 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2023-2026 |
| DNA甲基化和組蛋白修飾的結構基礎、動態調控及靶向干預 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2023-2028 |
| B細胞抗體多樣化 | 國家杰出青年科學基金 | 2024-2028 |
| 功能性piRNA鑒定及piRNA調控規則研究 | 基金委重點項目 | 2024-2028 |
| 糖脂代謝重編程驅動腫瘤細胞周期進程的作用與機制 | 基金委重大研究計劃 | 2024-2026 |
| 骨折損傷修復過程的信息解碼與調控機制研究 | 基金委重大研究計劃 | 2024-2026 |
| 多尺度鄰近標記技術解析組織微環境調控器官再生的機制 | 基金委重大研究計劃 | 2024-2026 |
| 時空多組學解碼肝臟損傷的有序修復和再生障礙機制 | 基金委重大研究計劃 | 2024-2027 |
| 神經精神藥物藥理 | 國家杰出青年科學基金 | 2023-2027 |
| 肝臟生物學和免疫學 | 基金委創新研究群體項目 | 2023-2027 |
| PIEZOs蛋白介導髓核力學穩態抑制椎間盤退變的分子機制研究 | 基金委重點項目 | 2023-2027 |
| 精神壓力通過抑制RNF168促進腫瘤發生發展的作用機制研究 | 基金委重點項目 | 2023-2027 |
| 成熟RNA核降解的命運決定機制及生物學功能研究 | 基金委重點項目 | 2023-2027 |
| 纖毛感受器中膜蛋白質動態周轉的調節機理與功能研究 | 基金委重點項目 | 2023-2027 |
| 基于在體蛋白質伙伴組的組織損傷修復機制研究 | 基金委重大項目 | 2023-2027 |
| 肝臟損傷修復過程中關鍵蛋白質類群鑒定及相關蛋白質標簽小鼠的規?；瘶嫿?/td> | 基金委重大項目 | 2023-2027 |
| 肝臟損傷修復過程中蛋白質群體的在體功能機制研究 | 基金委重大項目 | 2023-2027 |
| 環形RNA動態折疊的模擬及功能驗證 | 上海市生物醫藥定向項目 | 2023-2026 |
| 樣本特異動態網絡標志物方法 | 上海市計算生物學重點專項 | 2023-2026 |
| 哺乳動物性染色體大規模遺傳改造新技術的建立及應用 | 上海市合成生物學重點專項 | 2023-2026 |
| 可相分離CAR的技術開發與功能評估 | 上海市細胞與基因治療專項 | 2023-2026 |
| 人類胰島體外擴增技術的開發和迭代 | 上海市細胞與基因治療專項 | 2023-2026 |
| RNA調控在精子形成及男性不育中的新功能機制研究 | 上海市基礎研究領域項目 | 2023-2026 |
| 非編碼RNA在配子發生及生殖障礙中的功能機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2022-2027 |
| 細胞尺度時空組學的動力學刻畫和因果推斷 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2022-2027 |
| 干細胞成瘤的時空演化規律及干預策略 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2022-2027 |
| 干細胞成瘤的治療靶點及干預策略研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2022-2027 |
| 干細胞成瘤的信號調控網絡研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2022-2027 |
| 間充質干細胞在組織器官穩態維持中的作用機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2022-2027 |
| 基于多模態數據的健康臨界狀態的數學刻畫與預警理論 | 基金委重點項目 | 2022-2026 |
| Hilnc調控脂肪代謝的生物學功能及機制研究 | 基金委重點項目 | 2022-2026 |
| 調控纖毛發生及運動的哺乳動物超大分子機器的結構與功能 | 基金委重點項目 | 2022-2026 |
| 腫瘤代謝重塑相關新促癌因子的鑒定、功能和干預策略 | 基金委重大研究計劃 | 2022-2025 |
| 糖脂功能代謝物的轉運、感知與免疫調控 | 基金委重大研究計劃 | 2022-2024 |
| 基于非平衡穩態動力學模型對細胞屬性轉換在肝損傷再生和肝癌形成的研究 | 基金委重大研究計劃 | 2022-2025 |
| 成體干細胞命運調控機理 | 國家杰出青年科學基金 | 2022-2026 |
| 肝臟損傷再生中發育信號和免疫因子交互調控細胞屬性轉變的研究 | 上海市基礎研究重大項目 | 2022-2025 |
| 環形RNA生成代謝的調控與功能 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2021-2026 |
| 環形RNA自身生成、代謝的途徑和調控機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2021-2026 |
| 發展環形RNA基礎研究和轉化應用的新技術 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2021-2026 |
| 生精微環境調控精子發生的機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2021-2024 |
| 腫瘤細胞的代謝調控 | 國家杰出青年科學基金 | 2021-2025 |
| 細胞間粘附信號對腸道上皮細胞可塑性的調控及機制 | 基金委重點項目 | 2021-2025 |
| Hippo信號通路關鍵靶基因的篩選鑒定及其在細胞命運決定中的作用機制 | 基金委重點項目 | 2021-2025 |
| 在體基因原位激活系統的建立及其在生殖前體細胞發育過程中的應用 | 基金委重點項目 | 2021-2025 |
| 端粒結構可塑性調控與細胞命運抉擇中的相變與相分離機制研究 | 基金委重大項目 | 2021-2025 |
| 小細胞肺癌化療耐藥的分子細胞基礎及克服策略 | 基金委重點項目 | 2021-2025 |
| Wnt信號調控DNA損傷修復的機制研究及靶向干預 | 基金委重大研究計劃 | 2021-2024 |
| 代謝物介導的生物大分子動態修飾在腫瘤轉移中的作用及調控機制 | 基金委重大研究計劃 | 2021-2024 |
| 膽固醇代謝調控T細胞腫瘤免疫應答的機制研究 | 基金委重大研究計劃 | 2021-2024 |
| T細胞的脂質指紋與功能機制研究 | 上海市基礎研究重大項目 | 2021-2024 |
| 細胞核亞結構域長非編碼RNA圖譜（LAND）解碼及功能研究 | 中國科學院穩定支持基礎研究研究青年團隊 | 2021-2026 |
| 代謝驅動的腫瘤轉移與免疫治療 | 中國科學院穩定支持基礎研究研究青年團隊 | 2021-2026 |
| 系統形成過程中細胞交互作用網絡及共性調控機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2020-2024 |
| 重要器官細胞增殖與分化過程中關鍵蛋白質機器的動態調控網絡及機制 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2020-2025 |
| 發現調控細胞增殖與分化新因子 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2020-2025 |
| 蛋白質機器實時動態在體功能研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2020-2025 |
| 蛋白質機器動態網絡作用機制研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2020-2025 |
| 腸道黏膜免疫關鍵蛋白質機器的功能機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2020-2025 |
| 細胞核亞結構域長非編碼RNA (LAND)?圖譜繪制及功能研究 | 上海市基礎研究重大項目 | 2020-2023 |
| 多組學數據采集與標準化系統 | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目） | 2020-2024 |
| RNA轉運與降解的機制和功能 | 基金委杰青 | 2020-2024 |
| 腫瘤細胞信號轉導 | 基金委杰青 | 2020-2024 |
| 卵子染色質動態變化的機制及其在動物生長發育中的調控作用 | 基金委重大項目 | 2020-2024 |
| 纖毛與個體發育器官形成的細胞機制 | 基金委重大項目 | 2020-2024 |
| 骨源性因子對骨骼自身及骨外重要器官/系統穩態維持的作用和機制 | 基金委重大項目 | 2020-2024 |
| 2型糖尿病發生發展過程的臨界狀態預測理論和生物信息學方法 | 基金委重點 | 2020-2024 |
| 肝臟損傷再生過程巨噬細胞對肝細胞重編程的作用和調控 | 基金委重點 | 2020-2024 |
| RNA甲基化修飾調控減數分裂 | 基金委重點 | 2020-2024 |
| 膽固醇代謝調控巨噬細胞抗感染抗腫瘤的研究 | 基金委重點 | 2020-2024 |
| 遺傳譜系示蹤與組織再生 | 基金委優青 | 2020-2022 |
| 非編碼RNA代謝與功能 | 基金委重大研究計劃 | 2020-2022 |
| 非編碼RNA在重大疾病發生發展中的作用機制 | 基金委重大研究計劃 | 2020-2022 |
| RNA調控與生殖 | 基金委創新群體 | 2019-2024 |
| 早期胚胎發育中甲基化譜式建立的代謝物調控 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2024 |
| 組織器官損傷修復的細胞基礎及關鍵因子 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2024 |
| 組織器官損傷修復過程中信號轉導與代謝的交互調控機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2024 |
| 心臟和肝臟細胞更新能力差異的分子基礎 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2024 |
| 調控代謝性細胞器的信號轉導機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2024 |
| 組織器官損傷修復的細胞基礎與分子調控機制 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2019-2024 |
| 免疫細胞介導的炎癥相關疾病 | 基金委杰青 | 2019-2023 |
| 綠藻Tet酶及其催化產生的DNA新修飾的功能研究 | 基金委重點 | 2019-2023 |
| 腫瘤膽固醇代謝物介導的免疫逃逸機制研究 | 基金委重點 | 2019-2023 |
| 應答激素的新的乳腺干細胞類型的發現及機制研究 | 基金委重點 | 2019-2023 |
| 小核仁RNA加工來源的兩類新型長非編碼RNAs的代謝和功能研究 | 基金委重點 | 2019-2023 |
| PIWI-ins元件在PIWI/piRNA調控和男性不育中的功能機制研究 | 基金委重點 | 2019-2023 |
| 細胞微環境鈣離子對淋巴細胞黏附可塑性的調控及其機制研究 | 基金委重點 | 2019-2023 |
| 染色體改造單倍體干細胞的構建及應用 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2023 |
| 染色體倍性異常單倍體干細胞的構建及應用 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2023 |
| 移植細胞命運追蹤及功能評價 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2023 |
| 建立針對造血干細胞的新型基因編輯技術 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2019-2023 |
| 染色體倍性改造干細胞的建立與應用 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2019-2023 |
| 衰老細胞的示蹤及其細胞命運可塑性研究 | 基金委重大研究計劃 | 2019-2022 |
| 蛋白質生物合成 | 基金委優青 | 2019-2021 |
| 腫瘤發生的細胞信號轉導機制 | 基金委優青 | 2019-2021 |
| 利用細胞示蹤新技術研究心血管系統細胞命運圖譜 | 上海市基礎研究重大項目 | 2019-2022 |
| 基于基因組標簽計劃的蛋白質圖譜研究 | 上海市生物醫藥重大項目 | 2019-2020 |
| T細胞分化調控關鍵蛋白質機器及功能機制研究?< | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2018-2023 |
| 核受體降解相關蛋白質機器及靶向干預 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2018-2023 |
| 長非編碼RNA的代謝與功能 | 基金委杰青 | 2018-2022 |
| 骨發育與重建及相關疾病的機制 | 基金委杰青 | 2018-2022 |
| 腫瘤發生及免疫應答的分子細胞信號機制 | 基金委杰青 | 2018-2022 |
| 利用半克隆技術篩選參與早期胚胎發育的關鍵雌性印記基因 | 基金委重點 | 2018-2022 |
| 遺傳操作新技術的建立及應用 | 基金委重點 | 2018-2022 |
| 不同組織間充質干細胞的發育起源與功能亞群鑒定? | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2018-2022 |
| 減數分裂啟動的分子機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2018-2021 |
| 固醇激素代謝機理及其在相關癌癥診治中的轉化研究 | 基金委優青 | 2018-2020 |
| 腫瘤免疫學 | 基金委創新群體 | 2017-2022 |
| 肺組織生理病理動態轉化的小鼠模型和類器官模型的構建及研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2022 |
| 生理病理轉化過程中蛋白質機器定量化及多組學數據測定 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2022 |
| 蛋白質機器動態網絡的臨界理論和方法研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2022 |
| 小?RNA-蛋白質機器在哺乳動物精子發生中的功能和機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2022 |
| 細胞運動關鍵輔助蛋白復合物的結構、組裝與功能 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2022 |
| 著絲粒蛋白質機器調控細胞命運抉擇的效應機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2022 |
| 調控肝臟發育及大小的Hippo相關關鍵蛋白質機器的鑒定及其運行機制研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2022 |
| 蛋白質機器在肺組織生理病理臨界轉化過程中的系統生物學研究 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2017-2022 |
| RNA-蛋白質機器在哺乳動物遺傳信息表達中的調控功能與機制 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2017-2022 |
| 細胞運動關鍵蛋白質機器的結構與功能研究 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2017-2022 |
| 免疫細胞多樣性產生中蛋白質機器調控基因組穩定性的機制 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2017-2022 |
| 器官體外制造 | 中科院戰略性先導科技專項A類（項目） | 2017-2022 |
| 細胞增殖與分化 | 基金委杰青 | 2017-2021 |
| 心血管發育與組織再生 | 基金委杰青 | 2017-2021 |
| 乳腺干細胞的調控機理 | 基金委杰青 | 2017-2021 |
| 細胞外基質蛋白1基因缺失導致巨噬細胞過度活化而誘導自發性炎癥性腸炎的機制研究 | 基金委重點 | 2017-2021 |
| 內胚層起源及內胚層細胞體內分化的調控機制 | 基金委重點 | 2017-2021 |
| 肝臟再生過程細胞可塑性的分子調控機制研究 | 基金委重點 | 2017-2021 |
| 發育中PRC1調控Hh信號通路Ci/Gli轉錄的分子機制及功能研究 | 基金委重點 | 2017-2021 |
| 中胚層譜系決定的轉錄調控機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2021 |
| 內胚層譜系決定的轉錄調控機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2017-2021 |
| 中內胚層細胞分化過程中干細胞命運決定的轉錄調控 | 科技部國家重點研發計劃項目 | 2017-2021 |
| PIWI/piRNA在哺乳動物精子形成及男性不育中的功能機制 | 基金委重大研究計劃 | 2017-2020 |
| 基于“人造精子”技術的復雜疾病建模研究 | 上海市基礎研究基金委重大項目 | 2017-2020 |
| 減數分裂分子基礎和健康精子評估方法研究 | 上海市基礎研究重大項目 | 2017-2020 |
| 血管穩態失衡中的細胞命運轉變及調控機制研究 | 基金委重大研究計劃 | 2017-2019 |
| 基于“人造精子”技術的重要基因標簽研究 | 上海市生物醫藥重大項目 | 2017-2019 |
| Neddylation-CRL蛋白質機器調控肺損傷誘發的慢性炎性微環境變化及機制 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2016-2021 |
| 細胞命運可塑性的分子基礎與調控 | 中科院戰略性先導科技專項B類（專項） | 2016-2021 |
| 細胞分裂方式的可塑性調控 | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目） | 2016-2021 |
| 細胞增殖、分化與死亡的可塑性調控 | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目） | 2016-2021 |
| 應激條件下細胞可塑性調控 | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目 | 2016-2021 |
| 氨基酸誘導的mTORC1信號通路調控的分子機制研究 | 基金委重點 | 2016-2020 |
| NKT細胞分化成熟的調控機制 | 基金委重點 | 2016-2020 |
| T細胞抗原特異性免疫應答的調控機制 | 基金委重點 | 2016-2020 |
| YAP調控器官發育及穩態維持的分子機制研究 | 基金委重點 | 2016-2020 |
| 蛋白C受體對乳腺干細胞的作用及機制 | 基金委重點 | 2016-2020 |
| 孤雄單倍體胚胎干細胞攜帶CRISPR-Cas9文庫用于篩選胚胎發育關鍵因子的研究 | 基金委重點 | 2016-2020 |
| Caprin-2在Wnt信號通路中的作用機制與生物學功能 | 基金委重點 | 2016-2020 |
| 染色體的結構與功能研究 | 基金委杰青 | 2016-2020 |
| 細胞黏附與遷移機理 | 基金委杰青 | 2016-2020 |
| 腫瘤與蛋白質穩態異常 | 基金委杰青 | 2016-2020 |
| 基于多種族2型糖尿病早期生物標記物發現及其指導的個體化疾病干預研究 | 基金委國際合作與交流項目 | 2016-2020 |
| 動物流感病毒免疫學研究 | 科技部國家重點研發計劃課題主持 | 2016-2020 |
| 肝臟炎癌惡性轉化關鍵節點的動態網絡標志物模型及臨床應用研究 | 基金委重大研究計劃 | 2016-2018 |
| 染色質共價修飾在表觀遺傳調控中的機制研究（表觀遺傳學） | 基金委創新群體 | 2016-2018 |
| 抗腫瘤藥物的個性化分層研究 | 中科院戰略性先導科技專項A類（項目） | 2015-2020 |
| 關鍵理論和模型的研發與支撐? | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目） | 2015-2019 |
| 小分子介導的功能神經元的重建及在疾病模型中的應用 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2015-2019 |
| 基于編程和重編程的功能細胞的獲取與應用研究 | 上海市基礎研究重大項目 | 2015-2018 |
| 單倍體干細胞的建立、維持和應用 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2014-2018 |
| 單倍體干細胞表觀遺傳特性維持的研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 單倍體干細胞二倍體化的細胞周期相關機制研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 單倍體干細胞的應用研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 精子發生與成熟的表觀遺傳調控 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2014-2018 |
| 精原干細胞命運決定的表觀遺傳調控 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 圓形精子細胞變形的表觀遺傳調控 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 精子成熟的表觀遺傳調控 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 建立多能干細胞向中胚層細胞分化的體系并研究其調控機制 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 多能干細胞分化所得中胚層細胞的功能鑒定 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2014-2018 |
| 遺傳信息的解碼與維護 | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目） | 2014-2018 |
| 超大分子復合體前沿技術 | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目） | 2014-2018 |
| 關鍵理論和模型的研發與支撐 | 中科院戰略性先導科技專項B類（項目） | 2014-2018 |
| 適應性免疫的起源與演化 | 科技部973計劃項目 | 2013-2017 |
| 抗原受體多樣性的形成機制及其起源 | 科技部973計劃課題主持 | 2013-2017 |
| 染色體結構與功能 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2013-2017 |
| 蛋白質復合物調控染色體結構的分子機理 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2013-2017 |
| ncRNA調控染色體的分子機理 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2013-2017 |
| 端粒與染色體穩定性 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2013-2017 |
| 染色體調控異常與人類疾病 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2013-2017 |
| 干細胞標志分子的網絡關聯研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2013-2017 |
| 基于賴氨酸修飾相關的腫瘤治療靶標鑒定及先導化合物的篩選 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2013-2017 |
| 神經元形態發生的調控機理 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2013-2017 |
| 炎癥誘導腫瘤的分子調控網絡研究 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2012-2016 |
| 炎癥誘導腫瘤的信號轉導網絡研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 炎癥誘導腫瘤中的miRNA調控網絡研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 炎癥相關腫瘤中癌基因和抑癌基因的異常調控網絡研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 炎癥誘導腫瘤中的免疫調控網絡研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 上皮組織的形成、更新及其調節機理 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2012-2016 |
| 上皮組織干細胞的更新與分化 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 纖毛化上皮細胞的分化與功能 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 組蛋白甲基化修飾重要調控蛋白質的結構分析 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 蛋白質生物合成的質量控制 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 蛋白質錯誤折疊及分子伴侶的作用 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| MSC自我更新與分化的表觀遺傳學調控 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 天然免疫應答相關蛋白的結構生物學研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2012-2016 |
| 代謝生理活動與病理過程中信號轉導網絡的系統生物學研究 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2011-2015 |
| 基于BMP與GPCR等信號分子調控的代謝生理活動與病理過程的動態分子網絡的定量化研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 基于BMP與GPCR等信號分子調控的代謝生理活動與病理過程的動態分子網絡的信息整合與分析 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 細胞譜系的建立與發育調控 | 中科院戰略性先導科技專項A類（項目） | 2011-2015 |
| 亞細胞代謝調控及其相關老年癡呆癥等疾病機理 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2011-2015 |
| 細胞質膜的脂質代謝調控與功能結構域 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 內質網蛋白質代謝調控與應激信號通路 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 基于上海同步輻射光源的結構生物學技術和方法研究 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2011-2015 |
| 高效率、高精度和自動化的同步輻射數據收集、處理和結構解析系統的研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 干細胞編程與重編程中表觀遺傳調控的分子機制和結構基礎 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2011-2015 |
| 干細胞編程與重編程中表觀遺傳密碼建立和維持的分子機制和結構基礎 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| GPCR信號轉導網絡在代謝生理活動與病理過程中的作用機制研究 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| Hh梯度形成和信號轉導的調控機制 | 科技部重大科學研究計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 微RNA關鍵結合蛋白的功能與機制 | 科技部973計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 體細胞重編程微RNA功能及調控網絡 | 科技部973計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 非編碼RNA與蛋白質相互作用在干細胞命運決定過程中的調控網絡 | 科技部973計劃課題主持 | 2011-2015 |
| 炎癥過程中細胞黏附的信號轉導機制 | 科技部973課題主持 | 2010-2014 |
| 炎癥過程中細胞極性形成的信號轉導機制 | 科技部973課題主持 | 2010-2014 |
| 成形素誘導的信號轉導通路的調控機制 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2010-2014 |
| 細胞生長過程細胞骨架可塑性的調控機制 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2010-2014 |
| 人細胞質氨基酰-trNA?合成酶的研究 | 基金委重點 | 2010-2013 |
| 神經元受體和離子通道軸漿運輸的調控機制 | 基金委重點 | 2010-2013 |
| Wnt信號轉導與調控的分子機制 | 基金委重點 | 2010-2013 |
| 精子在附睪成熟得分子機理的研究 | 基金委重點 | 2010-2013 |
| 免疫學 | 基金委杰青 | 2010-2013 |
| 生物化學 | 基金委杰青 | 2010-2013 |
| 細胞生長調控的重要蛋白質群的功能與作用機制 | 科技部重大科學研究計劃項目 | 2009-2014 |
| 脂質代謝關鍵蛋白質的功能與調控機制 | 科技部重大研究計劃首席科學家 | 2009-2013 |
| 誘導多能干細胞（iPS）的重編程機制 | 科技部重大研究計劃首席科學家 | 2009-2013 |
| 脂質合成與吸收的關鍵膜蛋白及其復合物 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2009-2013 |
| iPS重編程過程中的表觀遺傳學調控作用 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2009-2013 |
| 組蛋白H4的K5/8/12乙酰化“密碼”的建立及解讀 | 基金委重大研究計劃 | 2009-2012 |
| 新的組蛋白去甲基化酶的鑒定及其生物學功能研究 | 基金委重大研究計劃 | 2009-2012 |
| 模擬人體內環境研究白念珠菌形態轉變的分子機制 | 基金委重點 | 2009-2012 |
| BMP信號在中樞神經系統發育過程中作用機制研究 | 基金委重點 | 2009-2012 |
| Nudel\Lis1\Dynein通路調節細胞骨架的組織和功能的機制 | 基金委重點 | 2009-2012 |
| 建立基于綿羊誘導性多能干細胞（iPS細胞）的基因定點整合和敲除的轉基因操作關鍵技術 | 農業部重大專項 | 2009-2010 |
| δ阿片受體拮抗劑作為抗老年癡呆癥新藥的研究 | 衛生部重大專項 | 2009-2010 |
| Robo1-Fc重組蛋白治療腫瘤生長和轉移的臨床前研究 | 衛生部重大專項 | 2009-2010 |
| 新的端粒酶抑制蛋白LPTS的抗腫瘤藥效研究 | 衛生部重大專項 | 2009-2010 |
| 重組端粒酶抑制蛋白LPTS的制備和抗腫瘤藥效研究 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 戰勝癌癥的新策略和新方法 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 建立豬誘導多能干細胞系（iPS）進而建立豬胚胎干細胞系（ESC）的研究 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 表觀遺傳網絡和BMP信號調控胚胎干細胞神經分化的分子機制 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 核移植與iPS技術誘導體細胞重編程的比較研究 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 紡錘體基質蛋白質在胚胎干細胞維持和分化中的功能 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 體外誘導鼠尾纖維細胞轉分化為肝細胞的研究 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 應激反應導致認知障礙的分子生物學基礎 | 中科院重要方向項目 | 2009-2010 |
| 化學小分子對于G蛋白偶聯受體介導的蛋白-蛋白相互作用影響的研究 | 基金委重大研究計劃 | 2008-2011 |
| 上皮細胞轉分化與凋亡命運的選擇及其調控機理 | 基金委重點 | 2008-2011 |
| 參與組蛋白修飾的重要蛋白質和蛋白質復合物的結構與功能研究 | 基金委重點 | 2008-2011 |
| 細胞極性影響細胞增殖、遷移和腫瘤發生發展的機理 | 基金委重點 | 2008-2011 |
| DNA甲基轉移酶復合物在胚胎發育表觀遺傳調控中的作用及其機制 | 基金委重點 | 2008-2011 |
| 新型原子力顯微鏡和微型光鑷的研發與應用 | 中科院重要方向項目 | 2008-2011 |
| 蛋白質復合物動態變化的分子機制與功能 | 科技部重大研究計劃項目 | 2007-2011 |
| 胚胎干細胞定向分化過程中關鍵科學問題的研究 | 科技部重大研究計劃項目 | 2007-2011 |
| 功能性T細胞亞群的免疫調節及其相關機制的研究 | 科技部973課題主持 | 2007-2011 |
| 原始免疫重排機理和形成機制及其比較免疫學研究 | 科技部973課題主持 | 2007-2011 |
| 蛋白質復合物的動態轉運 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 蛋白質復合物的動態網絡 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 研究轉錄因子及轉錄輔助因子（Co-factors）在胚胎干細胞定向分化中的作用 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 研究由胚胎干細胞來源的分化細胞在動物體內的功能 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 利用光反射差系統開展附睪中miRNA的生物功能及作用機制研究 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 參與基因表達調控的蛋白質及蛋白質復合物的結構與功能研究 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 胚胎早期發育關鍵環節的生物學基礎 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 功能特異性細胞發育的調控機理 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 中科院干細胞庫及干細胞基因操作技術平臺 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2007-2011 |
| 癌癥的靶向基因-病毒治療產品的研發 | 科技部863重點 | 2007-2010 |
| V(D)J重組關鍵調控基因的篩選與功能作用 | 科技部863專題 | 2007-2010 |
| 端粒酶亞基及端粒結合蛋白復合體Cdc13p/Stn1p/Ten1p, Ku70/80在端粒DNA復制中的作用 | 基金委重點 | 2007-2010 |
| P-選凝素參與的信號轉導對白細胞黏附和遷移運動的調節 | 基金委重點 | 2007-2010 |
| 分子生物學國家重點實驗室 | 基金委重點 | 2007-2010 |
| 中科院分子細胞生物學重點實驗室 | 基金委重點 | 2007-2010 |
| G蛋白偶聯受體調節基因轉錄和細胞功能的表觀遺傳機制 | 基金委杰青 | 2007-2010 |
| 抗2型糖尿病候選新藥和干預新方法的系統性研究 | 中科院重大項目 | 2007-2010 |
| 海洋生物多肽毒素及活性多肽的基礎研究與藥物應用 | 中科院重要方向項目 | 2007-2010 |
| Wnt和BMP信號通路在脊椎動物胚胎體軸形成及神經分化過程中的功能及其相互作用機理 | 中科院重要方向項目 | 2007-2010 |
| 細胞活動過程中的動態蛋白質組研究 | 中科院重要方向項目 | 2007-2010 |
| 真核基因轉錄調控中重要蛋白質復合物的結構與功能研究 | 中科院重要方向項目 | 2007-2010 |
| 細胞極性（polarity）影響細胞增殖和腫瘤發生的機制 | 中科院重要方向項目 | 2007-2010 |
| 膽固醇代謝平衡調控及相關代謝性疾病的分子機理 | 中科院重要方向項目 | 2007-2010 |
| 核移植誘導體細胞重編程的研究 | 中科院重要方向項目 | 2007-2010 |
| 2型糖尿病發生發展機制的研究 | 科技部973首席科學家 | 2006-2011 |
| 細胞命運決定的分子網絡 | 基金委創新群體 | 2006-2011 |
| 胚胎干細胞全能性關鍵分子的調控機制 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2006-2011 |
| 多潛能干細胞向器官原基干細胞分化的信號調控網絡 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2006-2011 |
| 膽固醇代謝平衡調控及其相關重要疾病的代謝組學機理 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2006-2011 |
| 精子功能的基礎與臨床研究 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2006-2011 |
| 干細胞命運決定的分子調控網絡 | 科技部重大研究計劃首席科學家 | 2006-2011 |
| 蛋白質的錯誤折疊和聚集 | 科技部重大研究計劃課題主持 | 2006-2011 |
| 2型糖尿病發生過程中的分子網絡與作用機制研究 | 科技部973課題主持 | 2006-2011 |
| 抗心腦血管凝血，抗炎及抗病毒感染單抗藥物的研制及應用 | 科技部863重大 | 2006-2010 |
| 神經變性病的神經元選擇性變性的機制 | 科技部973課題主持 | 2006-2010 |
| 輔助性T細胞分化的分子機制的研究 | 基金委重點 | 2006-2009 |
| 七次跨膜受體介導的信號轉導與調控的分子網絡 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 胚胎干細胞向肝細胞、神經細胞分化的調控機制研究 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 精子成熟的分子基礎及臨床應用 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 細胞遷移在炎癥、血栓和腫瘤中的作用 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 禽流感病毒與宿主細胞相互作用的分子機理研究 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 非編碼RNA結構與功能及其介導基因表達調控的作用機理研究 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 前列腺癌干細胞的分離鑒定及靶向基因治療 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 癌癥的靶向基因治療研究 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| I型糖尿病和缺血性器官損傷(心肌梗塞、腎移植)防治的新靶點及其分子機制 | 中科院重要方向項目 | 2006-2009 |
| 組織工程化組織形成與轉歸機制 | 科技部973課題主持 | 2005-2011 |
| 腫瘤和神經系統疾病的表觀遺傳機制 | 科技部973項目 | 2005-2010 |
| DNA甲基化譜式的建立與維持 | 科技部973課題主持 | 2005-2010 |
| 染色質結構與功能 | 科技部973課題主持 | 2005-2010 |
| 細胞信號轉導對表觀遺傳網絡的調節作用 | 科技部973課題主持 | 2005-2010 |
| miRNA在細胞分化和心血管病中的作用 | 科技部973課題主持 | 2005-2010 |
| 小分子非編碼RNA與蛋白質相互作用的分子基礎及機制 | 科技部973課題主持 | 2005-2010 |
| 細胞分化和定向遷移的分子調節機制 | 基金委創新群體 | 2005-2010 |
| 細胞信號轉導及反饋調控 | 基金委創新群體 | 2001-2009 |
